MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017167	CTT	2	6	174080	174085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133960
4003	NC_017167	ATC	2	6	174122	174127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133960
4004	NC_017167	TCA	2	6	174141	174146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133960
4005	NC_017167	TCCA	2	8	174182	174189	25 %	25 %	0 %	50 %	384133960
4006	NC_017167	CGG	2	6	174210	174215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133960
4007	NC_017167	AACGG	2	10	174242	174251	40 %	0 %	40 %	20 %	384133960
4008	NC_017167	CGG	2	6	174255	174260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133960
4009	NC_017167	TCA	2	6	174270	174275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133960
4010	NC_017167	GAC	2	6	174302	174307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133960
4011	NC_017167	GTC	2	6	174347	174352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133960
4012	NC_017167	CCA	2	6	174613	174618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133961
4013	NC_017167	GCAT	2	8	174625	174632	25 %	25 %	25 %	25 %	384133961
4014	NC_017167	CGG	2	6	174643	174648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133961
4015	NC_017167	G	6	6	174674	174679	0 %	0 %	100 %	0 %	384133961
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4017	NC_017167	CAC	2	6	174842	174847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133961
4018	NC_017167	TGACC	2	10	174883	174892	20 %	20 %	20 %	40 %	384133961
4019	NC_017167	GC	3	6	174928	174933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_017167	GTGC	2	8	175062	175069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_017167	GA	3	6	175086	175091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017167	ATC	2	6	175126	175131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017167	GTC	2	6	175188	175193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133962
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4030	NC_017167	GC	3	6	175434	175439	0 %	0 %	50 %	50 %	384133962
4031	NC_017167	TGGTCG	2	12	175469	175480	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384133962
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4034	NC_017167	CGCA	2	8	175630	175637	25 %	0 %	25 %	50 %	384133962
4035	NC_017167	TG	3	6	175643	175648	0 %	50 %	50 %	0 %	384133962
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4040	NC_017167	CGGA	2	8	175832	175839	25 %	0 %	50 %	25 %	384133962
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4045	NC_017167	CTG	2	6	176014	176019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133962
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4049	NC_017167	AGCGC	2	10	176108	176117	20 %	0 %	40 %	40 %	384133962
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4054	NC_017167	TGC	2	6	176369	176374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133962
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4063	NC_017167	TTG	2	6	176791	176796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017167	CGG	2	6	176832	176837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017167	TA	3	6	176864	176869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4090	NC_017167	GGCGT	2	10	177773	177782	0 %	20 %	60 %	20 %	384133963
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4096	NC_017167	GC	3	6	178010	178015	0 %	0 %	50 %	50 %	384133963
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4102	NC_017167	CG	4	8	178175	178182	0 %	0 %	50 %	50 %	384133963
4103	NC_017167	GGA	2	6	178192	178197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133963
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4106	NC_017167	CAT	2	6	178264	178269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133963
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4110	NC_017167	CATC	2	8	178545	178552	25 %	25 %	0 %	50 %	384133964
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4117	NC_017167	ACGGC	2	10	178823	178832	20 %	0 %	40 %	40 %	384133964
4118	NC_017167	AAC	2	6	178921	178926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133964
4119	NC_017167	GC	3	6	178947	178952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_017167	GGA	2	6	178966	178971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017167	GCGG	2	8	178975	178982	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4123	NC_017167	GA	3	6	179024	179029	50 %	0 %	50 %	0 %	384133965
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4367	NC_017167	CAC	2	6	187211	187216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133971
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4473	NC_017167	CACC	2	8	191378	191385	25 %	0 %	0 %	75 %	384133976
4474	NC_017167	CAT	2	6	191435	191440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133976
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4479	NC_017167	CG	3	6	191593	191598	0 %	0 %	50 %	50 %	384133976
4480	NC_017167	GAA	2	6	191622	191627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133976
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4482	NC_017167	CAT	2	6	191705	191710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133976
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4485	NC_017167	GCG	2	6	191782	191787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133976
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4488	NC_017167	GCG	2	6	191974	191979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133976
4489	NC_017167	CG	3	6	191986	191991	0 %	0 %	50 %	50 %	384133976
4490	NC_017167	TCGCG	2	10	192008	192017	0 %	20 %	40 %	40 %	384133976
4491	NC_017167	CG	4	8	192014	192021	0 %	0 %	50 %	50 %	384133976
4492	NC_017167	CGG	2	6	192083	192088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133976
4493	NC_017167	CGA	2	6	192134	192139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133976
4494	NC_017167	CCTC	2	8	192166	192173	0 %	25 %	0 %	75 %	384133976
4495	NC_017167	CGA	2	6	192237	192242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4496	NC_017167	ATCCG	2	10	192270	192279	20 %	20 %	20 %	40 %	384133977
4497	NC_017167	CG	3	6	192325	192330	0 %	0 %	50 %	50 %	384133977
4498	NC_017167	CCTG	2	8	192335	192342	0 %	25 %	25 %	50 %	384133977
4499	NC_017167	CGG	2	6	192359	192364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133977
4500	NC_017167	GC	3	6	192368	192373	0 %	0 %	50 %	50 %	384133977

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